双螺杆压缩机是燃料电池空压机的常见类型之一。在双螺杆压缩机的机体中，平行配置着一对相互啮合的螺旋形转子。通常将节圆外为凸齿的称作阳转子或阳螺杆；将节圆外为凹齿的称作阴转子或阴螺杆。一般阳转子与原动机连接，由阳转子带动阴转子转动。转子排气端上的球轴承使转子实现轴向定位，并承受压缩机中的轴向力。阴阳螺杆在啮合转动的工程中，齿间容积不断减小，从而实现对空气的压缩。双螺杆式压缩机在工作时，一般分为吸气过程、压缩过程和排气过程。在吸气过程中，阴阳螺杆尚未啮入前与吸气孔相通，处于吸气状态，当螺杆转到一定位置时，阴阳螺杆之间的螺槽封闭，此时吸气过程结束；吸气过程结束后，阴阳螺杆继续转动，封闭的工作容积逐渐缩小，实现气体的压缩过程，当工作容积与排气孔口连通时，压缩过程结束；工作容积与排气孔口连通后，随着阴阳螺杆继续转动，被压缩气体由排气孔口输送至排气管道，直至齿槽完全脱离啮合为止。